身体长期发热39℃会引发诸多不良反应，如消化道基础功能受损、头部疼痛、四肢发软等，需依据实际情况选取针对性方法加以缓解。
一、消化道基础功能受损
身体发热39℃可能是由于体内脏器受到外界环境中细菌、病毒、支原体等微生物刺激，进而导致体内脏器出现炎症反应。当体内炎症反应较为严重时，会使体表温度过高，对胃肠道等消化器官产生刺激，引起消化道基础功能受损，患者会出现食欲下降、腹痛、腹胀、恶心等症状。对此，可按医嘱使用对乙酰氨基酚片、布洛芬缓释胶囊等药物进行治疗。
二、头部疼痛
身体发热后可能会影响颅脑体温调节中枢的正常活动，易导致脑部神经递质传递紊乱，造成脑内神经组织受损，从而引发头部疼痛，并常伴有头晕、精神状态较差等表现。若头部疼痛症状极为严重，在用药阶段可通过保持充足的睡眠时间来辅助改善症状。
三、四肢发软
发热不仅会造成脑内神经递质传递紊乱，还有可能影响四肢末梢神经组织活动，可能导致末梢神经组织出现轻微损伤，引起四肢发软等状况。如果末梢神经受损较为严重，可配合医生使用腺苷钴胺片、维生素B12片等药物进行改善。
此外，还可能造成身体水分大量流失，引发电解质紊乱，可通过药物治疗方式进行改善。
总之，身体长期发热39℃会带来多种不良后果，应及时关注并采取相应措施进行缓解和治疗。