小孩扁桃体肥大主要与反复感染等因素有关。据统计，儿童期扁桃体是免疫器官，易受病原微生物侵袭而反复发炎，从而导致扁桃体肥大。
感染因素：反复的炎症刺激
病毒感染： 像EB病毒、腺病毒等感染，会引发扁桃体炎症反应，长期反复的病毒感染会促使扁桃体淋巴组织增生，进而导致扁桃体肥大。例如，在病毒流行季节，儿童感染相关病毒后，若未得到有效控制，就容易出现扁桃体肥大情况。细菌感染： A族乙型溶血性链球菌是常见的引发扁桃体细菌感染的病原体。当小孩咽部受到该细菌侵袭时，会引起扁桃体炎，炎症反复刺激会使扁桃体组织充血、水肿，逐渐肥大。比如，小孩感冒后若合并细菌感染，引发扁桃体化脓性炎症，就可能导致扁桃体肥大。
生理性肥大阶段
婴幼儿时期： 婴儿出生后扁桃体就开始逐渐发育，在2 - 5岁时是扁桃体生理性肥大的高峰期。这一阶段小孩的扁桃体淋巴组织活跃，可能会看起来比成人的扁桃体相对肥大，但一般属于正常的生理现象，通常随着年龄增长会逐渐萎缩。学龄前期： 3 - 6岁的儿童扁桃体仍处于相对活跃的发育状态，此阶段如果没有频繁的炎症刺激，多数孩子的扁桃体肥大情况会在青春期后逐渐缓解。但如果有反复炎症，就可能持续肥大。
过敏因素影响
过敏性鼻炎引发： 当小孩患有过敏性鼻炎时，鼻腔的过敏反应可能会蔓延至咽部，引起扁桃体的过敏炎症反应。过敏物质刺激扁桃体，导致扁桃体组织水肿、增生，进而出现肥大。例如，对花粉过敏的小孩，在花粉季接触花粉后，可能同时出现过敏性鼻炎和扁桃体肥大的情况。食物过敏相关： 部分小孩对某些食物过敏，如牛奶、鸡蛋等，过敏反应累及咽部时，也可能导致扁桃体肥大。食物过敏引起的扁桃体炎症反应会使扁桃体组织发生病理改变，出现肥大表现。