软疣的治疗方法有多种，一般可以通过局部治疗等方式来处理。比如对于单个的软疣，可采用夹除术等方法。
局部治疗方法
夹除术： 这是比较常用的方法，医生会用镊子将软疣小体完全夹除，然后局部涂抹碘伏进行消毒。一般操作后要注意保持局部清洁，避免感染。通常一次夹除后如果处理干净，就能起到治疗效果，但如果软疣较多可能需要多次操作。冷冻治疗： 利用低温液氮使软疣组织坏死脱落。冷冻治疗后局部可能会出现水疱，要注意不要弄破水疱，让其自然吸收。一般冷冻一次可能需要间隔几周再看恢复情况，如果没好可能需要再次冷冻。
药物辅助治疗
外用药物： 可以使用一些抗病毒的外用药物，像酞丁安软膏等。酞丁安软膏有一定的抗病毒作用，涂抹在软疣患处，每天涂抹几次。不过药物治疗相对夹除术等方法效果可能稍慢一些，而且对于较大或较多的软疣，单纯药物治疗可能不够理想。免疫调节剂： 对于免疫力较低容易反复出现软疣的患者，可能会考虑使用免疫调节剂，但这类药物的使用需要在医生的严格评估下进行，因为其有一定的适应证和禁忌证等情况。
日常注意事项
避免搔抓： 软疣部位不要用手去搔抓，防止自身接种传播，也就是防止软疣扩散到身体其他部位。因为搔抓可能会使软疣病毒传播到周边皮肤，导致更多部位出现软疣。注意个人卫生： 要保持皮肤清洁，勤换衣物。尤其是贴身的衣物，避免与他人共用毛巾、浴巾等个人物品，防止交叉感染。比如不要和别人共用洗澡巾，以防将软疣病毒传染给他人。增强免疫力： 平时要注意合理作息，保证充足的睡眠，均衡饮食，适当进行体育锻炼等，以提高自身免疫力。免疫力强有助于身体更好地对抗软疣病毒，减少软疣的发生和复发。比如每天保证7 - 8小时的睡眠时间，饮食上多吃蔬菜水果、优质蛋白等。