孕酮低可能由多种原因引起。一般来说，女性黄体功能不全是常见原因之一，黄体功能不全时，黄体分泌的孕酮量会不足。另外，内分泌失调也可能导致孕酮低，比如甲状腺功能异常等情况可能影响激素的平衡，进而使孕酮水平降低。还有些女性是因为患有一些疾病，像多囊卵巢综合征，这类患者体内激素代谢紊乱，也容易出现孕酮低的状况。
黄体相关因素导致孕酮低
卵巢黄体发育不全： 正常情况下，卵巢排卵后会形成黄体，黄体可以分泌孕酮。如果卵巢黄体发育不全，就会使得黄体分泌的孕酮量减少。比如在月经周期中，黄体期本该有足够的孕酮支撑，但由于黄体发育不完善，孕酮水平就会偏低。黄体功能萎缩不全： 黄体功能萎缩不全时，黄体持续的时间会比正常情况长，不过其分泌孕酮的功能却出现异常，导致孕酮不能按时下降，或者下降不彻底，从而出现孕酮低的情况。
内分泌失调引发孕酮低
甲状腺功能异常： 甲状腺是人体重要的内分泌器官，当甲状腺功能出现亢进或者减退时，都会影响到整体的内分泌平衡。例如甲状腺功能减退时，身体的代谢等多种功能受到影响，可能会波及到孕酮的分泌，导致孕酮水平降低。其他激素失衡： 体内雌激素等其他激素的失衡也可能间接影响孕酮的水平。比如雌激素分泌过多或过少，都可能打破激素之间的平衡关系，进而导致孕酮低。像一些患有内分泌疾病的女性，由于多种激素紊乱，就容易出现孕酮低的现象。
疾病因素导致孕酮低
多囊卵巢综合征： 多囊卵巢综合征患者的卵巢存在排卵障碍，而且体内雄激素水平偏高，这会干扰正常的激素代谢，使得孕酮的合成和分泌受到影响，从而出现孕酮低的情况。这类患者通常还会伴有月经不调、排卵异常等表现。肾上腺疾病： 肾上腺是分泌激素的重要器官，如果肾上腺出现病变，比如患有肾上腺皮质功能亢进等疾病，会影响到激素的分泌调节，可能导致孕酮水平降低。肾上腺疾病会打乱体内的激素平衡，进而对孕酮的产生造成不利影响。