宝宝躺下就咳嗽，原因主要包括以下方面：一是宝宝器官、组织发育不完全，吞咽能力不成熟，躺下时若枕头过低易被唾液呛到而咳嗽，调整后能改善则无需特殊处理；二是症状不缓解甚至加重，可能受疾病因素影响，如鼻后滴漏综合征、胃食管反流等。
一、鼻后滴漏综合征：常见于患有慢性鼻窦炎与鼻炎的部分宝宝。宝宝躺下时，鼻腔中的脓性分泌物会倒流至咽喉部，从而引发咳嗽，通常还伴有鼻塞等症状。这是因为宝宝本身存在鼻部疾病，在特定体位下导致分泌物反流刺激咽喉。
二、胃食管反流：宝宝胃容量小、贲门处较松且胃非竖直状态，若吃得太饱，躺下时胃内未消化完的内容物可能反流到食管，刺激咽喉引起咳嗽，同时可能伴有腹痛、腹胀等表现。这主要是由于宝宝胃部的生理特点以及进食情况共同作用导致的。
总之，宝宝躺下就咳嗽若调整后未改善且持续加重，应警惕是否存在相关疾病，需及时就医进行诊断和相应处理。