双肾海绵肾的严重程度需综合多方面来看，一般来说，大部分双肾海绵肾患者病情相对稳定，但也有少数可能出现一些问题。约半数左右的双肾海绵肾患者可能长期没有明显症状，对生活影响不大。
临床表现情况
无症状情况： 很多双肾海绵肾患者没有任何不适症状，往往是在体检做B超或其他检查时偶然发现，这种情况相对不严重，对肾脏功能和日常生活影响较小。有症状情况： 部分患者可能出现血尿，一般量不多，多数为镜下血尿，少数为肉眼血尿；也可能出现反复尿路感染，表现为尿频、尿急、尿痛等症状，若频繁发作尿路感染可能会对肾脏功能有一定潜在影响，但及时治疗控制后，多数预后较好。
对肾脏功能的影响
早期影响： 在疾病早期，双肾海绵肾对肾脏功能的影响通常不明显，肾小球滤过率等指标多在正常范围内。晚期影响： 少数病情进展的患者，可能会逐渐出现肾脏功能减退，不过这种情况相对较少见，一般在几十年的病程中才可能逐渐显现，而且通过积极控制并发症等措施可以延缓肾脏功能恶化的进程。
并发症情况
结石形成： 双肾海绵肾患者容易形成肾石，这是比较常见的并发症。如果结石较小，可能没有明显症状；但如果结石较大或引起梗阻，可能会导致腰痛、肾积水等情况，不过通过及时处理结石，如体外冲击波碎石或手术取石等，多数可以解决问题，相对来说通过规范治疗后一般不会造成严重后果。高血压： 极少数双肾海绵肾患者可能会并发高血压，但通过合理控制血压，使用降压药物等，多数也能将血压控制在正常范围，对健康的主要威胁可得到有效管控。