晚上嘴巴臭的原因包括生理性因素、牙周感染、牙结石、口腔溃疡、胃食管反流病等，应经医生综合评估后进行相应治疗。具体如下：
一、生理性因素：唾液一般有抗菌、杀菌及清洁口腔的作用，在晚上睡眠时唾液分泌量会显著减少，使得杀菌作用变弱，且会产生大量挥发性硫化物、氨等物质，这样就会引发短暂性的嘴巴臭症状，这属于正常的生理性情况，无需特殊处理和治疗。
二、牙周感染：如果存在牙龈炎、牙周炎等炎症性病变，会造成牙龈出血以及炎性分泌物增多，进而导致厌氧菌发酵产生挥发性硫化物、氨等物质，从而出现晚上嘴巴臭的表现。首先要特别注意口腔卫生，必要时可依照医嘱选用甲硝唑、替硝唑等药物进行治疗。
三、牙结石：若平时不注重口腔卫生，可能会致使钙化沉积物在牙齿上堆积，晚上睡觉时由于进食减少以及唾液分泌减少，会让口腔内的细菌发酵从而产生嘴巴臭的现象。首先要保持良好的口腔卫生，必要时可遵循医嘱选择牙结石洁治术及刮治术等方法进行治疗。
四、口腔溃疡：由感染、物理刺激等引发的口腔溃疡性病变，表现为口腔黏膜局部出现缺损，这也可能导致细菌发酵进而出现嘴巴臭的症状。首先要保持口腔卫生并多喝水，必要时可根据医嘱选用氯己定含漱液、曲安奈德等药物进行治疗。
五、胃食管反流病：主要是由于食管下段括约肌松弛，使得胃内容物及胃酸反流到咽喉部及口腔，到了晚上反流物在口腔中发酵，产生挥发性硫化物及氨等物质，进而出现嘴巴臭的情况。可以依照医嘱选择奥美拉唑、硫糖铝等药物进行治疗。
当出现上述不适症状后，应尽快前往医院就诊，在医生的指导下明确病因后尽早进行规范治疗，以防错过最佳治疗时机。