甲状腺素低通常是指甲状腺功能减退，其常见原因有以下几类：
自身免疫性疾病相关原因
自身免疫性甲状腺炎： 这是导致甲状腺素低比较常见的原因。比如慢性淋巴细胞性甲状腺炎（桥本病），自身免疫系统错误地攻击甲状腺组织，使得甲状腺滤泡细胞受损，影响甲状腺激素的合成和分泌。据统计，在甲状腺功能减退的患者中，因自身免疫性甲状腺炎引起的占相当大比例。碘摄入异常： 如果碘摄入不足，会影响甲状腺激素的合成原料。例如，一些地区饮食中碘含量长期偏低，就可能导致甲状腺素合成减少，引发甲状腺功能减退。而如果碘摄入过量，也可能干扰甲状腺的正常功能，引起甲状腺素低的情况，不过这种情况相对碘摄入不足来说较少见。
甲状腺手术或放射性碘治疗后
甲状腺手术因素： 当因甲状腺结节、甲状腺癌等疾病进行甲状腺部分或全部切除手术后，剩余的甲状腺组织不能正常分泌足够的甲状腺素。一般来说，手术切除甲状腺组织越多，发生甲状腺素低的风险越高。比如甲状腺癌患者进行全甲状腺切除术后，很大概率会出现甲状腺素低，需要长期补充甲状腺素制剂。放射性碘治疗因素： 对于甲状腺功能亢进患者采用放射性碘治疗时，放射性碘会破坏甲状腺细胞，使得甲状腺合成甲状腺素的能力下降。治疗后的几个月到几年内，可能会逐渐出现甲状腺素低的情况，而且个体差异较大，有的患者可能较早出现，有的相对较晚。
垂体或下丘脑疾病影响
垂体疾病： 垂体是调节甲状腺功能的重要内分泌器官，如果垂体发生病变，如垂体肿瘤、垂体炎症等，会影响促甲状腺激素（TSH）的分泌。TSH能刺激甲状腺分泌甲状腺素，当TSH分泌不足时，甲状腺素的分泌就会减少。例如垂体瘤患者，若肿瘤影响了促甲状腺激素细胞的功能，就可能导致甲状腺素低。下丘脑疾病： 下丘脑分泌的促甲状腺激素释放激素（TRH）会影响垂体分泌TSH。当下丘脑出现病变，如下丘脑肿瘤、炎症等，会使TRH分泌减少，进而影响垂体分泌TSH，最终导致甲状腺素低。比如下丘脑肿瘤压迫周围组织，影响了TRH的正常分泌，就可能引发甲状腺功能减退相关的甲状腺素低情况。