五个月宝宝晚上睡觉总醒来可能有以下这些原因：
一、维生素D缺乏：通常在未补充维生素D3或补充不充分的宝宝身上较为常见。这时除了夜间睡眠不安稳、易醒外，还会有夜间哭闹、多汗、摇头以及枕秃等表现。对此可采取给宝宝补充维生素D3、多晒太阳以及适当进行户外活动等措施，能逐渐使其缓解。
二、胃肠功能紊乱：若宝宝存在受凉情况，或者平时胃肠功能一般，本身就有大便次数增多、大便性状改变等肠道问题，那么宝宝可能因胃肠道不适而在睡觉时总是醒来。这时需要给宝宝口服益生菌或者调节胃肠功能的中成药物进行治疗。
三、饮食结构紊乱：5个月的宝宝已可以适当添加辅食，若添加辅食过量或添加辅食的顺序不当，会导致宝宝胃肠功能紊乱或过敏等情况，进而出现睡眠不安稳、总是醒来的现象。此时需要注意宝宝的饮食结构，不可过多过快地调整。
四、惊吓：有一部分宝宝受到惊吓后，容易在夜间出现异常哭闹，给予安抚后可缓解。
总之，宝宝夜间总醒的原因较多，必要时需及时到医院就诊。