上呼吸道感染并不就是新冠状病毒感染。上呼吸道感染是包括鼻腔、咽或喉部急性炎症的总称，其病原体多样，病毒占70% - 80%，常见的有鼻病毒、冠状病毒等，但还有细菌等其他病原体也可引起。而新冠状病毒感染是由特定的新型冠状病毒引起的。
病原体差异
病毒类病原体： 普通上呼吸道感染的病毒除了冠状病毒，还有鼻病毒，鼻病毒感染后常表现为鼻塞、流涕等症状，全年均可发病，以秋冬和春季多见。而新冠状病毒感染除了有呼吸道症状外，还可能有发热、乏力等全身症状，且有一定的流行特点，如在特定时期集中爆发。细菌类病原体： 部分上呼吸道感染由细菌引起，像A组β溶血性链球菌，它引起的上呼吸道感染可能会有咽痛明显、扁桃体红肿有脓性分泌物等表现。而新冠状病毒感染一般不是由细菌导致。
症状表现区别
普通上呼吸道感染： 症状相对较局限，以局部呼吸道症状为主，比如单纯的咳嗽、打喷嚏，一般全身症状较轻，发热多为低热或中度发热，持续时间较短。例如普通的病毒性上呼吸道感染，发热可能1 - 3天就消退。新冠状病毒感染： 症状相对多样，除了呼吸道症状外，全身症状往往更明显，部分患者会出现高热，体温可超过38.5℃，且发热持续时间可能较长，还可能伴有肌肉酸痛、乏力等情况，严重的还可能出现呼吸困难等表现。
诊断方法不同
普通上呼吸道感染： 主要通过医生的问诊，结合临床表现来初步判断，一般不需要特殊的复杂检查。如果要进一步明确病毒类型等，可能会做病毒抗原检测等，但相对简单。新冠状病毒感染： 诊断需要依靠核酸检测等特异性检测方法，通过采集鼻咽拭子等标本进行新冠病毒核酸检测来确诊，这是区别于普通上呼吸道感染的重要诊断依据。