噬血细胞综合征的症状较多，常见的有发热，通常体温可超过38.5℃，且持续时间较长，可能反复发热。
发热表现：
持续高热： 体温往往在39℃以上，而且发热不容易通过普通的退热措施完全缓解，会反复出现。发热伴随不适： 发热时患者常伴有全身乏力、精神萎靡等表现。
血液系统症状：
贫血相关： 患者会出现面色苍白，活动后容易气短、心慌等症状。血常规检查可见血红蛋白降低。血小板减少表现： 皮肤可能出现瘀点、瘀斑，还可能有鼻出血、牙龈出血等情况，因为血小板减少会影响凝血功能。
肝脾淋巴结肿大情况：
肝脾肿大： 可在腹部摸到肝脾肿大，右上腹可能有胀痛感，通过腹部B超等检查能发现肝脾体积增大。淋巴结肿大： 颈部、腋窝、腹股沟等部位的淋巴结可能肿大，一般质地偏软，有的可能有轻度压痛。
其他系统表现：
消化系统症状： 可能出现食欲减退、恶心、呕吐、腹痛、腹泻等症状，影响患者的营养摄入。神经系统症状： 部分患者会有头痛、精神差，严重的可能出现抽搐、意识障碍等，这是因为疾病累及神经系统。