阴茎上长肉疙瘩可能是尖锐湿疣，也可能是皮脂腺囊肿。可通过服用相应药物、涂抹药膏、手术或激光等方式治疗。具体如下：
一、尖锐湿疣：
1.多因性生活或个人卫生不佳致人类乳头瘤病毒感染引起，常发生于生殖器和肛门周围，有赘生物且表皮粗糙。可进行醋酸白试验确诊。
2.治疗上可服用抗病毒药物，如阿昔洛韦等，同时结合激光去除赘生物。
二、皮脂腺囊肿：
1.由皮脂腺分泌物过多堵塞所致，会出现肉疙瘩，若遭细菌感染还可能发炎红肿。
2.可涂抹莫匹罗星软膏等抑菌消炎软膏，同时服用罗红霉素等抗生素控制感染，炎症消退后可行手术切除囊肿。
总之，当阴茎出现肉疙瘩时，应及时就医明确病因，然后根据具体情况选择合适的治疗方法。