临床上最常见的慢性呼吸衰竭病因是慢性阻塞性肺疾病（COPD），约占所有慢性呼吸衰竭病因的40% - 70%。
慢性阻塞性肺疾病相关情况
气道病变方面： 慢性阻塞性肺疾病主要是因为气道出现持续的气流受限，这种气流受限通常是进行性发展的。长期的吸烟是重要的诱因，据统计，长期吸烟的人群中患慢性阻塞性肺疾病的概率比不吸烟人群高很多。气道会出现炎症反应，导致气道黏膜肿胀、分泌物增多，进一步加重气流受限。肺部组织病变方面： 肺部的肺泡结构也会受到破坏，引发肺气肿。肺泡壁被破坏后，肺泡融合成大的气肿囊腔，使得肺的弹性回缩力下降，气体在肺内潴留，影响气体交换。而且患者的肺组织会出现慢性炎症，持续的炎症反应会不断损伤肺组织，影响正常的呼吸功能，进而引发慢性呼吸衰竭。
其他常见病因及情况
胸廓病变： 严重的胸廓畸形就是其中之一，比如脊柱侧弯严重的患者，会影响胸廓的正常形态和肺的扩张。胸廓畸形会使胸腔的容积变小，肺的扩张受到限制，导致通气功能障碍。还有胸廓手术以后的患者，如果恢复不良，也可能影响胸廓的正常结构和肺的功能，从而引发慢性呼吸衰竭。神经肌肉病变： 脊髓灰质炎会影响呼吸相关的神经功能，导致呼吸肌无力。脊髓灰质炎病毒会侵犯脊髓前角运动神经元，使得支配呼吸肌的神经传导受到影响，呼吸肌无法正常收缩和舒张，影响肺的通气功能。重症肌无力也是常见的神经肌肉病变，患者体内的自身抗体破坏神经肌肉接头处的乙酰胆碱受体，导致肌肉无力，呼吸肌受累时就会引起呼吸功能障碍，长期可发展为慢性呼吸衰竭。
肺血管病变相关情况
慢性血栓栓塞性肺动脉高压： 由于肺部的血管内形成血栓，并且没有完全溶解，长期存在的血栓会导致肺动脉高压。血栓会阻塞肺动脉，使肺循环阻力增加，右心需要更大的力量来将血液泵入肺动脉，长期下去会影响右心功能，同时也会影响肺的气体交换，最终引发慢性呼吸衰竭。这种情况相对来说发病率不如慢性阻塞性肺疾病高，但也是慢性呼吸衰竭的病因之一。