尿的时候尿道痛可能由多种原因引起。比如尿道炎就比较常见，像淋菌性尿道炎，是由淋病奈瑟菌感染所致，主要通过性接触传播；非淋菌性尿道炎多由衣原体、支原体等感染引起。一般来说，这类感染导致尿道痛时，还可能伴有尿道分泌物增多等情况。
尿道炎导致尿道痛
淋菌性尿道炎： 由淋病奈瑟菌感染引发，主要通过性接触传播，感染后短期内就可能出现尿道痛，伴有尿频、尿急，尿道还会流出脓性分泌物。非淋菌性尿道炎： 多由衣原体、支原体等感染引起，起病相对较缓慢，尿道痛程度一般较轻，尿道分泌物多为稀薄的黏液性。
膀胱炎引发尿道痛
急性膀胱炎： 常因细菌感染引起，除了尿道痛，还会有尿频、尿急，严重时可能出现血尿，排尿终末时尿道痛往往比较明显。慢性膀胱炎： 多由急性膀胱炎迁延不愈所致，尿道痛症状相对较轻，但会反复出现，病程较长，可能会影响患者的生活质量。
泌尿系统结石造成尿道痛
尿道结石： 如果尿道内有结石，结石会刺激尿道黏膜，导致尿道痛，这种痛可能比较剧烈，还可能伴有排尿困难，尿线变细等情况。膀胱结石： 膀胱结石也会引起尿道痛，疼痛可放射至阴茎头部，在排尿过程中结石移动可能会导致尿道痛加剧，有时还会出现排尿中断现象。
其他可能原因
尿道损伤： 比如尿道器械检查、性生活损伤等，会引起尿道痛，有明确的损伤史，损伤后马上或随后就会出现尿道痛。过敏反应： 对某些物质过敏，如使用某些避孕套、清洁剂等，也可能导致尿道痛，同时可能伴有尿道局部的红肿等过敏表现。