脑干损伤后有一定概率出现后遗症。一般来说，约30% - 50%的脑干损伤患者会遗留不同程度的后遗症。
后遗症的表现类型
意识障碍相关后遗症
长期昏迷： 脑干损伤严重时，患者可能陷入长期昏迷状态，如植物生存状态。部分患者昏迷时间可长达数月甚至数年。这是因为脑干中与意识维持相关的结构受损，影响了正常的意识觉醒机制。意识模糊： 患者清醒程度下降，对自身和周围环境的感知混乱，不能清晰地理解指令和表达自身需求，这种情况可能会持续存在。
运动功能相关后遗症
肢体瘫痪： 脑干损伤可能导致四肢或部分肢体出现不同程度的瘫痪。比如，一侧或双侧肢体肌力下降，活动受限。这是由于脑干内控制运动传导的神经纤维束受损，影响了神经信号向肢体的传导。运动协调障碍： 患者会出现共济失调等运动协调问题，走路不稳，动作笨拙，难以完成精细动作，如拿东西时手的抖动、握物不稳等。这是因为脑干中参与运动协调的神经结构受损，影响了运动的平衡和精准控制。
颅神经功能相关后遗症
眼球运动障碍： 可能出现眼球不能正常转动、复视等情况。脑干内有控制眼球运动的颅神经核团及相关神经纤维，损伤后会影响眼球的正常运动功能。吞咽困难： 患者吞咽食物和唾液困难，容易导致呛咳，进而引发肺部感染等并发症。这是因为脑干中控制吞咽功能的神经结构受损，影响了吞咽反射的正常进行。
其他相关后遗症
认知障碍： 部分患者可能出现认知功能减退，如记忆力下降、注意力不集中、思维能力减弱等。脑干的损伤可能影响了与认知相关的神经通路和脑区的功能联系。二便失禁： 由于脑干损伤影响了自主神经功能，可能导致患者出现大小便失禁的情况，给患者的生活带来极大不便，也增加了护理的难度。