通常来说，跑步时头疼可能有多种情况，包括正常生理现象，也可能是一些疾病因素导致，比如低血糖、偏头痛等，可通过相应方式来缓解。
一、正常生理现象：在跑步时，患者体内血液循环会显著加快，同时会消耗大量氧气，这样通常会致使患者出现脑缺血、脑缺氧等状况，从而引发头疼。这属于正常情况，一般通过休息就能缓解。
二、低血糖：其产生往往和饮食不规律、体力活动过度等有关，会让患者在跑步时出现头疼、乏力等表现。缓解药物有：
1.葡萄糖注射液；
2.注射用呋塞米等。
三、偏头痛：主要由遗传、生活压力过大等因素诱发，也会导致患者在跑步时出现头疼、恶心等症状。可使用的缓解药物包括：
1.双氯芬酸钠缓释胶囊；
2.布洛芬缓释胶囊等。
总之，跑步时头疼要根据具体情况来判断和处理，若是疾病因素导致要及时就医并遵医嘱治疗。