大脚趾灰指甲可以通过外用药物、口服药物以及手术等方法治疗。一般来说，外用抗真菌药物治疗轻度灰指甲有一定效果，比如常用的阿莫罗芬搽剂，每周使用1 - 2次，坚持使用数月可能看到改善。
外用药物治疗
阿莫罗芬搽剂： 它是一种局部外用的抗真菌药，通过干扰真菌细胞膜麦角固醇的合成，发挥抗真菌作用。使用时要先清洁病甲，然后均匀涂抹在病甲及周围皮肤，每周使用1 - 2次，需要持续使用数月才能看到较好效果。环吡酮胺乳膏： 同样属于外用抗真菌药，能抑制真菌细胞膜的合成，从而达到抗菌的目的。涂抹在大脚趾灰指甲处，每天使用1 - 2次，坚持使用一段时间，对改善灰指甲状况有帮助，但要注意避免接触眼睛和口、鼻等黏膜处。
口服药物治疗
伊曲康唑： 是一种口服的抗真菌药物，它可以抑制真菌细胞的麦角固醇合成，起到抗真菌作用。一般采用冲击疗法，即服用一周，停药三周为一个疗程，需要根据灰指甲的严重程度进行多个疗程的治疗。不过，服用伊曲康唑前需要检查肝功能，因为它可能对肝脏有一定影响，肝功能异常者要谨慎使用。特比萘芬： 也是口服抗真菌药，能特异性地抑制真菌角鲨烯环氧化酶，阻碍真菌细胞膜的合成。通常每天服用一次，连续服用数周，具体疗程要根据大脚趾灰指甲的恢复情况来定。同样，服用前也需要关注肝功能等情况。
手术治疗
拔甲术： 对于单个严重的大脚趾灰指甲，可以考虑拔甲术。但拔甲后要注意预防感染，需要定期换药，让新的指甲慢慢生长出来。不过，拔甲后新长出来的指甲刚开始可能比较脆弱，需要精心护理，而且拔甲后还可能存在灰指甲复发的情况。激光治疗： 利用特定波长的激光照射病甲，破坏真菌的生存环境，达到治疗灰指甲的目的。一般需要多次治疗，每次治疗时间较短，治疗过程相对较舒适，对周围正常组织损伤较小，但费用相对可能较高。