密集恐惧症的引起目前尚未有非常明确统一的定论，但有一些相关因素被认为可能与之有关。一般来说，密集恐惧症可能与遗传因素有关，有研究发现如果家族中有成员患有此类恐惧症，那么其他成员患病的风险可能会相对增高。
遗传因素方面
家族遗传倾向： 有调查显示，大约有一定比例的密集恐惧症患者有家族遗传背景，比如如果父母一方患有密集恐惧症，其子女患病的概率会比正常人群有所升高，但具体的遗传模式还不是完全清晰，可能涉及多基因遗传等复杂情况。
大脑神经机制方面
视觉处理差异： 从大脑神经角度来看，正常人和密集恐惧症患者在对密集排列物体的视觉处理上存在不同。当看到密集排列的物体时，密集恐惧症患者的大脑某些特定区域，如视觉皮层相关区域以及情感调节区域等的反应与常人不同。例如，他们大脑中处理恐惧情绪相关的脑区可能会过度激活，导致产生强烈的不适、恐惧等情绪反应。发育因素： 在个体发育过程中，如果在关键的神经发育阶段受到一些不良因素的影响，也可能导致密集恐惧症的出现。比如在儿童青少年时期，大脑神经发育还不完善，如果频繁接触到可能引发恐惧反应的密集物体场景，并且没有得到及时正确的引导，就有可能逐渐形成密集恐惧症。
心理社会因素方面
早期经历影响： 早期的生活经历也可能是诱发密集恐惧症的因素之一。比如有些人在童年时期曾经目睹过或者接触到一些与密集排列物体相关的令人恐惧、不安的场景，像看到密集排列的虫卵、密集的小孔等场景且当时产生了强烈的负面情绪体验，那么随着成长，就可能在类似场景出现时触发密集恐惧症的反应。文化与社会认知： 不同的文化和社会认知也可能对密集恐惧症的形成有一定作用。在一些文化环境中，可能对某些密集排列的事物有着相对负面的认知和渲染，使得个体在成长过程中受到这种文化氛围的影响，从而更容易产生对密集物体的恐惧反应。