密集恐惧症的引起目前尚无确切的单一原因定论，但有一些相关因素被认为可能与之相关。一般来说，密集恐惧症可能与遗传因素有一定关联，有研究发现，如果家族中有患密集恐惧症的成员，那么个体患病的风险可能会相对增加。
遗传因素方面：
家族遗传倾向： 研究表明，遗传基因在一定程度上会影响个体对密集型事物产生恐惧的易感性。如果父母等直系亲属患有密集恐惧症，其子女患上该病的概率可能比正常人群高出一定比例，但具体的遗传方式还不是完全清晰明确。
大脑神经机制方面：
视觉处理差异： 从大脑神经角度来看，有些人的视觉系统对密集排列的物体信息处理与常人不同。当看到密集的小孔、小颗粒等物体时，大脑的特定区域可能会产生过度的反应，导致恐惧情绪的产生。例如，正常情况下大脑能够平稳处理的视觉信息，在密集恐惧症患者那里，会引发大脑中与恐惧情绪相关的神经通路被过度激活。
成长经历方面：
早期不良刺激： 个体在成长过程中如果有过特定的不良经历也可能引发密集恐惧症。比如，小时候看到过令人不适的密集图案且当时产生了强烈的负面情绪体验，这种经历可能会在心理上留下印记，随着成长，当再次接触到类似密集图案时，就容易触发恐惧反应。还有一些人可能在观看影视作品等过程中接触到密集相关场景并受到惊吓，也可能逐渐形成密集恐惧症。