牙根部位坏死、牙齿发黑可能是以下原因导致的：
1.牙髓坏死：牙髓组织发生炎症或感染后，会导致牙髓坏死。如果不及时治疗，牙髓坏死后会分解产生黑色素，导致牙齿逐渐变黑。此外，外伤、龋齿等也可能导致牙髓坏死。
2.牙根吸收：牙根吸收是指牙根的组织逐渐被吸收，导致牙根变短、牙齿松动。牙根吸收后，牙本质暴露，容易受到外界因素的影响而变色，从而出现牙齿发黑的情况。
3.四环素牙：在牙齿发育期间，服用了四环素类药物，会导致牙齿着色，使牙齿呈现出棕灰色或棕黑色。四环素牙通常发生在前牙，尤其是上颌前牙。
4.氟斑牙：长期饮用含氟量过高的水，或长期暴露在高氟环境中，会导致牙齿出现斑釉样改变，使牙齿表面呈现出白垩色或褐色的斑块，严重时也会导致牙齿发黑。
5.其他原因：吸烟、喝咖啡、喝茶等习惯，以及某些系统性疾病（如贫血、铅中毒等）也可能导致牙齿发黑。
如果发现牙齿发黑，建议及时就医，进行口腔检查和诊断。医生会根据具体情况制定相应的治疗方案，可能包括根管治疗、牙齿美白、修复治疗等。同时，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙，有助于预防牙齿疾病的发生。