牙齿根部牙龈发黑可能是由于长期吸烟、喝咖啡、喝茶等导致的色素沉着，也可能是牙结石、龋齿、牙龈萎缩或全身性疾病、某些口腔疾病、牙齿受过外伤等原因引起。
牙齿根部牙龈发黑，可能与以下原因有关。
1.色素沉着
(1)长期吸烟、喝咖啡、喝茶等，可能导致色素沉着在牙齿根部牙龈，使牙龈看起来发黑。
(2)某些药物，如某些抗生素和抗抑郁药，也可能导致牙龈色素沉着。
2.牙结石
牙结石是由牙菌斑和食物残渣在牙齿表面沉积形成的，它会刺激牙龈，导致牙龈发炎、红肿，甚至出血。如果牙结石长期存在，可能会使牙龈变黑。
3.龋齿
龋齿（蛀牙）会导致牙齿表面的珐琅质受损，形成龋洞。如果龋洞没有及时治疗，可能会深入到牙髓，导致牙髓坏死。牙髓坏死会导致牙齿变黑，并且可能会引起牙龈发炎、肿胀。
4.牙龈萎缩
随着年龄的增长，牙龈可能会逐渐萎缩，暴露出牙根。牙根表面没有釉质的保护，容易受到外界因素的影响，如牙结石、细菌等，从而导致牙龈发黑。
5.其他原因
(1)全身性疾病，如铅中毒、糖尿病等，可能会导致牙龈色素沉着。
(2)某些口腔疾病，如牙龈炎、牙周炎等，也可能导致牙龈发黑。
(3)牙齿受过外伤，如撞击、摔伤等，可能会导致牙髓坏死，从而使牙齿变黑。
如果发现牙齿根部牙龈发黑，建议及时就医，进行口腔检查和诊断。医生会根据具体情况，制定相应的治疗方案。同时，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙，有助于预防牙龈疾病的发生。