牙齿从根部发黑可能是以下原因导致的：
1.龋齿：如果牙齿表面有龋洞，细菌会分解食物中的糖分产生酸，导致牙齿脱矿，进而形成龋齿。龋齿会使牙齿表面的颜色发生变化，从白色逐渐变为黄色或黑色。
2.牙结石：牙结石是由牙菌斑和食物残渣在牙齿表面沉积形成的。牙结石会使牙齿表面变得粗糙，容易吸附更多的细菌和色素，从而导致牙齿变黑。
3.四环素牙：在牙齿发育期间，如果服用了四环素类药物，药物会与牙齿中的钙结合，形成四环素钙复合物，导致牙齿变色，从黄色到棕色，甚至黑色。
4.牙髓坏死：如果牙齿受到外伤、龋齿等原因导致牙髓感染或坏死，牙髓中的血红蛋白会分解产生黑色素，导致牙齿从根部开始变黑。
5.吸烟：长期吸烟会使牙齿表面吸附大量的尼古丁和其他色素，从而使牙齿变黑。
6.其他原因：某些系统性疾病（如铅中毒）或使用某些药物（如铁剂）也可能导致牙齿从根部开始变黑。
如果发现牙齿从根部发黑，建议及时就医，医生会根据具体情况进行诊断和治疗。如果是龋齿或牙结石引起的，可以通过洗牙、补牙等方法进行治疗；如果是牙髓坏死导致的，可能需要进行根管治疗和牙冠修复；如果是四环素牙或其他原因引起的，可能需要进行更复杂的治疗方法。此外，保持良好的口腔卫生习惯，定期洗牙，戒烟等也有助于预防牙齿变色。