目前并没有所谓的“胃窦炎特效药”，治疗胃窦炎通常是根据病情综合用药。一般会用到抑制胃酸分泌的药物，比如质子泵抑制剂，像奥美拉唑，它能有效减少胃酸分泌，缓解胃窦炎引起的烧心、反酸等症状；还有H₂受体拮抗剂，如雷尼替丁，也可起到抑制胃酸的作用。另外，胃黏膜保护剂也常用，例如铝碳酸镁，能在胃黏膜表面形成保护膜，减轻胃酸等对胃窦黏膜的刺激。
抑制胃酸分泌类药物
质子泵抑制剂：这类药物能高度选择性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌的终末步骤。常见的有奥美拉唑，它能有效降低胃酸浓度，一般疗程可能根据病情在1 - 8周不等，适用于胃酸分泌过多导致胃窦炎症状明显的患者。H₂受体拮抗剂：通过阻断组胺H₂受体来抑制胃酸分泌。像雷尼替丁，它可以持续抑制基础胃酸和刺激引起的胃酸分泌，通常口服后1 - 3小时起效，能缓解胃窦炎患者因胃酸过多引发的不适。
胃黏膜保护剂
铝碳酸镁：它可以中和胃酸，并且能吸附胃蛋白酶等物质，还能促进胃黏膜前列腺素的合成，对胃窦黏膜起到保护作用。它服用后可能在半小时内就开始发挥作用，能快速缓解胃窦炎导致的胃痛、胃胀等症状，一般可以长期服用，但需遵循医嘱。硫糖铝：能在胃内酸性环境下形成保护膜，附着在胃窦黏膜表面，保护黏膜免受胃酸、胆汁等的损伤。它服用后在胃内停留时间较长，大概2 - 4小时开始发挥作用，对于有胃窦黏膜损伤的患者适用。
有幽门螺杆菌感染时的用药
如果胃窦炎是由幽门螺杆菌感染引起的，通常需要进行四联疗法，即一种质子泵抑制剂 + 两种抗生素 + 一种铋剂。比如质子泵抑制剂用奥美拉唑，抗生素可以选择阿莫西林、克拉霉素，铋剂选用枸橼酸铋钾。一般疗程为10 - 14天，通过杀灭幽门螺杆菌来从根源上治疗胃窦炎。但这类药物的使用需要严格遵循医嘱，因为不同患者的情况不同，比如对某些抗生素过敏的患者就不能选用相应的抗生素。
特殊人群用药注意
老年人：老年人使用治疗胃窦炎的药物时要特别注意，比如质子泵抑制剂，可能需要调整剂量，因为老年人的肝肾功能可能有所减退，药物代谢会变慢，要防止药物在体内蓄积产生不良反应。儿童：儿童患胃窦炎时用药更需谨慎，一般会选择相对安全的药物，比如胃黏膜保护剂可能会选用适合儿童的剂型，但抑制胃酸分泌的药物使用要严格按照儿童的体重等情况由医生来确定剂量，不能随意用药。