巧克力囊肿是子宫内膜异位症的一种常见类型，其症状表现多样。一般来说，约1/3的患者可能没有明显症状，但多数患者会出现痛经、月经异常等情况。
痛经情况
进行性加重的痛经： 这是巧克力囊肿比较典型的症状之一。很多患者会发现，从有月经开始就没有痛经或者痛经不严重，但随着患巧克力囊肿时间的推移，痛经会逐渐加重。这种痛经往往在月经来潮前1 - 2天开始，月经第一天最严重，以后逐渐减轻，可持续整个经期。比如有的患者以前月经时只是轻微下腹不适，患巧克力囊肿后，经期下腹会出现剧烈疼痛，影响正常生活和工作。疼痛部位与范围： 疼痛多位于下腹部深部和腰骶部，可放射至会阴、肛门、大腿部位。有的患者疼痛范围还可能波及盆腔其他区域，让患者感觉全身都不舒服。
月经异常表现
月经量增多： 部分患者会出现月经量比以往明显增多的情况。正常月经量一般在20 - 60毫升，而患有巧克力囊肿的患者，可能会超过80毫升。这是因为囊肿影响了卵巢的正常功能，导致子宫内膜面积相对增大等因素引起的。月经周期改变： 月经周期可能会出现提前或者推迟的情况。正常月经周期一般是21 - 35天，患病后有的患者周期可能缩短至20天左右，有的则会延长到40天以上，而且月经经期也可能不太规律，时而延长，时而缩短。
盆腔疼痛相关
性交疼痛： 当囊肿累及盆腔腹膜等组织时，在性生活过程中可能会出现疼痛。尤其是在月经前期，这种性交疼痛可能会更加明显。比如有的女性在同房时会感觉下腹部深部疼痛，影响性生活质量。盆腔隐痛： 除了经期和性交时的疼痛外，部分患者在非经期也会有盆腔隐痛的情况，这种隐痛可能会持续存在，时轻时重，让患者感觉盆腔一直有不适感。