口腔溃疡的引发原因较多，一般认为约20%~30%的人受遗传因素影响易长口腔溃疡，比如父母双方都易长口腔溃疡，子女患病几率会明显增高。
一、局部创伤因素
口腔咬伤： 比如吃饭时不小心咬到口腔黏膜，就可能在1~2周内形成口腔溃疡，这种创伤性溃疡通常能自己慢慢恢复，但期间要注意别再刺激伤口。假牙摩擦： 不合适的假牙长时间摩擦口腔黏膜，也容易引发口腔溃疡，一般每天摩擦次数较多时，溃疡出现得更快，可能几天内就会有明显的溃疡症状。
二、免疫系统问题
免疫力低下时： 当人体免疫力下降，比如感冒发烧、过度劳累后，身体的免疫防御功能减弱，就容易让潜伏在口腔内的病毒或细菌活跃起来，从而引发口腔溃疡，这种情况在免疫力较差的人群中更常见，像一些经常熬夜、压力大的人就容易出现。自身免疫性疾病： 像白塞病等自身免疫性疾病，也会导致口腔溃疡反复发作，这类疾病引起的口腔溃疡往往比较顽固，可能还会伴有眼部、生殖器等部位的病变。
三、营养缺乏因素
维生素缺乏： 缺乏维生素B2、维生素B12等，会影响口腔黏膜的正常代谢，增加口腔溃疡的发生风险。比如长期吃素的人，如果饮食搭配不合理，就容易缺乏这些维生素，进而引发口腔溃疡，一般缺乏维生素B2时，可能还会伴有口角炎等表现。微量元素缺乏： 缺锌等微量元素也与口腔溃疡有关，锌在人体的免疫功能和黏膜修复等方面都有重要作用，当体内锌含量不足时，口腔黏膜的修复能力下降，就容易长口腔溃疡，这种情况在一些挑食、偏食的人群中较为常见。