口腔溃疡的引发原因较多，比如约20%的人有复发性阿弗他溃疡，其具体诱因尚不明确，但可能与免疫、遗传、环境等因素有关。
局部创伤因素
口腔内异物摩擦： 当口腔内有残根、残冠或者不合适的假牙时，这些异物会不断摩擦口腔黏膜，就容易引发口腔溃疡。比如有患者戴了不合适的假牙，持续摩擦口腔黏膜后，很快就出现了口腔溃疡。咬伤等机械损伤： 不小心咬伤口腔黏膜，比如吃饭时说话被咬到，也会形成口腔溃疡。这种情况在日常生活中很常见，一旦咬伤，口腔黏膜破损处就容易发展成溃疡。
免疫系统因素
免疫力下降时易发病： 当人体免疫力低下时，比如感冒发烧、过度劳累后，身体的免疫防御功能减弱，就更容易受到病原体的侵袭，从而引发口腔溃疡。有研究发现，在免疫力低下的时期，口腔溃疡的发病概率会明显升高。自身免疫反应异常： 当自身免疫系统出现异常时，免疫系统可能会错误地攻击自身的口腔黏膜组织，导致口腔溃疡的发生。例如患有自身免疫性疾病的人群，口腔溃疡的发生率相对较高。
营养缺乏因素
维生素缺乏： 缺乏维生素B族，尤其是维生素B2、B6等，会影响口腔黏膜的正常代谢，容易引发口腔溃疡。比如长期挑食、节食的人，很可能会出现维生素缺乏，进而导致口腔溃疡频繁发生。微量元素缺乏： 像锌、铁等微量元素缺乏也与口腔溃疡有关。锌参与人体多种代谢活动，缺乏锌时会影响伤口愈合等过程，容易引发口腔溃疡；铁是合成血红蛋白的重要原料，缺铁时也可能导致口腔黏膜抵抗力下降，诱发口腔溃疡。