肛周脓肿主要症状有局部疼痛，通常在发病初期就比较明显，尤其是在坐立、行走或排便时疼痛会加重，有的患者疼痛程度较为剧烈，甚至影响正常生活。还会出现局部红肿，病变部位皮肤会发红、肿胀，用手触摸能感觉到温度比周围皮肤高，一般红肿范围在2~3厘米左右，随着病情发展可能会逐渐扩大。另外，部分患者会有发热表现，体温可能会升高到38℃左右，严重时体温能达到39℃以上，同时还可能伴有乏力、食欲减退等全身不适症状。
局部疼痛表现
持续性疼痛：肛周脓肿引起的疼痛是持续性的，不会轻易缓解，这是因为脓肿在局部不断刺激周围组织。比如坐着的时候，臀部压迫病变部位，疼痛会更加明显。疼痛与排便相关：排便时，粪便通过肛门会刺激脓肿部位，导致疼痛加剧，有的患者排便后疼痛仍不会马上减轻。
局部红肿情况
红肿范围变化：初期红肿范围相对较小，可能直径在2厘米左右，之后会逐渐增大，有的能扩展到5厘米甚至更大。红肿部位特点：红肿部位皮肤紧张，颜色发红，用手触摸能感觉到硬结，按压时有明显的压痛感。
全身症状表现
发热程度差异：轻度肛周脓肿患者体温可能在38℃左右，属于低热情况；而病情较重的患者体温可高达39℃以上，呈现高热状态。全身不适表现：除了发热，患者还会感觉浑身没力气，不想吃东西，精神状态也比较差，这是因为身体在应对感染，消耗了较多能量。