检查直肠的方法包括：一、肛门指检。这是对肛门和直肠进行的触诊，在直肠检查时可以触摸到肛门口及直肠壁，在有相关指征时还可进一步进行双合诊。此检查方法简单方便且容易操作，对于肛门、直肠的局部病变有着非常重要的诊断价值。二、肛门镜检查。主要用于检查肛门和直肠的某些相关病变，并且能够在直视的情况下进行病理活检，从而明确诊断。三、结肠镜检查。若结肠镜检查发现直肠有肠腔病变，能够获取组织进行活检以及做病理切片检查。值得一提的是，结肠镜不仅可以当作检查的手段，同时还可作为治疗的方法，在检查过程中能够对一些直肠息肉进行切除，发挥出治疗的作用。
总结概况提示：以上详细介绍了三种检查直肠的主要方法及其特点和作用，肛门指检简便且对局部病变诊断重要，肛门镜检查可直视取活检，结肠镜检查既能检查又能治疗，可对直肠病变进行深入诊断和处理。