肾结石微创手术费用一般在1万~3万元左右，不过具体费用会因地区、医院级别、手术方式等因素有所不同。
手术方式不同费用有差异
输尿管软镜碎石术：这种手术相对来说费用大概在1万~2万元左右。它主要是通过尿道、膀胱进入输尿管，再到达肾脏，利用激光等将结石击碎取出。一般适用于结石较小且位置较特殊的情况。经皮肾镜碎石术：费用相对高一些，大概在2万~3万元左右。该手术是通过腰部建立通道进入肾脏，然后用器械将结石击碎取出。适用于较大的肾结石等情况。
地区差异影响费用
在一线城市的三甲医院，肾结石微创手术费用可能会偏高，大概在2.5万~3万元左右。而在一些县级医院，费用相对低些，可能在1万~2.5万元左右。这是因为一线城市的医疗成本、人力成本等更高。
医院级别不同费用有别
三甲医院：设备先进，专家资源丰富，肾结石微创手术费用通常处于较高水平，可能在2万~3万元。二甲医院：设备和专家资源相对三甲医院稍次，费用大概在1.5万~2.5万元。
患者自身情况的影响
如果患者在手术前还合并有其他基础疾病，需要先控制基础疾病，这可能会增加一些检查、治疗等费用，从而导致肾结石微创手术的总费用有所上升。比如患者合并有糖尿病，需要在术前将血糖控制稳定，这部分额外的费用就会使总费用增加。