判断生化妊娠是否干净可以从症状表现、血HCG监测以及超声检查等方面来进行。一般来说，可通过观察阴道出血情况、定期检测血HCG值变化以及进行超声检查来综合判断生化妊娠是否干净。
通过症状表现判断
阴道出血情况：生化妊娠后阴道出血通常会在7 - 10天内逐渐停止。如果阴道出血时间超过10天仍未干净，或者出血量突然增多，多于平时月经量，那就要考虑可能没有干净。例如，正常生化妊娠阴道出血时间一般较短，若超过10天还淋漓不尽，就需引起重视。腹痛情况：正常生化妊娠后腹痛会逐渐缓解。如果腹痛持续不缓解，甚至有加重趋势，也可能提示宫腔内有残留组织，影响子宫恢复，需要进一步检查是否干净。
血HCG监测判断
血HCG下降情况：生化妊娠后血HCG会逐渐下降，一般在流产后2 - 3周左右恢复到正常水平（小于5IU/L）。如果血HCG下降缓慢，或者下降后又上升，说明可能有妊娠组织残留，没有干净。比如，正常情况下生化妊娠后1 - 2周血HCG应明显下降，若4周后仍未降至正常范围，就要考虑残留可能。
超声检查判断
超声下宫腔情况：通过超声检查可以观察宫腔内是否有残留组织。正常生化妊娠超声检查宫腔内无异常回声，若超声显示宫腔内有不均质回声团等情况，提示可能有妊娠组织残留，意味着生化妊娠没有干净。一般在生化妊娠后1 - 2周可进行超声检查，明确宫腔内情况。