卵圆孔未闭与房间隔缺损都是心脏结构上的异常，但有明显区别。卵圆孔未闭是胎儿时期正常的生理结构，出生后1年左右约75%~80%的人会闭合，若3岁以上仍未闭合才称为卵圆孔未闭。而房间隔缺损是先天性心脏病的一种，是原始房间隔在胚胎发育过程中出现异常，导致左右心房之间遗留孔隙。
病变部位结构差异
卵圆孔未闭： 是在房间隔中部的一个潜在通道，正常胎儿时期，卵圆孔是左、右心房的血流通道，出生后随着肺循环建立，左心房压力升高，卵圆孔会逐渐闭合。一般来说，卵圆孔未闭的缺损口相对较小，直径通常在5毫米以下。房间隔缺损： 病变部位是整个房间隔上的孔隙，缺损大小不一，可分为原发孔型和继发孔型等，继发孔型房间隔缺损较为常见，缺损直径可能从几毫米到数厘米不等。
对人体影响不同
卵圆孔未闭： 大部分卵圆孔未闭的人没有明显症状，可能终身不会出现不适。但部分人可能会因为卵圆孔未闭导致反常栓塞，比如静脉系统的血栓通过未闭的卵圆孔到达动脉系统，引起脑栓塞等情况，不过这种情况相对少见，大约只有1/400的卵圆孔未闭患者会发生相关栓塞事件。房间隔缺损： 缺损较小时可能在儿童时期没有明显症状，但随着年龄增长，可能会出现活动后气促、乏力等表现。缺损较大时，会导致右心负荷加重，进而引起右心扩大、肺动脉高压等问题，严重影响心脏功能，甚至可能导致心力衰竭等严重后果。
诊断方法区别
卵圆孔未闭： 超声心动图是诊断卵圆孔未闭的主要方法，经胸超声心动图发泡试验是常用的检测手段，通过静脉注射微泡造影剂，观察微泡是否通过卵圆孔从右心房进入左心房来判断卵圆孔未闭是否存在。房间隔缺损： 超声心动图也是重要的诊断方法，可直接观察到房间隔的缺损部位和大小。另外，心导管检查也可以用于诊断房间隔缺损，通过心导管可以测量心房水平的分流情况等。
治疗方式有别
卵圆孔未闭： 一般来说，无症状的卵圆孔未闭不需要特殊治疗。但对于有反常栓塞高风险（如已有脑栓塞且经检查明确与卵圆孔未闭相关）的患者，可能会考虑进行介入封堵治疗，通过导管将封堵器送至卵圆孔未闭处进行封堵。房间隔缺损： 对于小型房间隔缺损，若没有明显症状，可先观察，定期复查心脏超声。而对于中型或大型房间隔缺损，以及有明显症状的小型房间隔缺损，通常需要进行介入治疗或外科手术修补，通过封堵器封堵缺损部位或直接修补房间隔来恢复心脏正常结构和功能。