发烧时全身痛主要是因为身体在应对感染等致热因素时，体内会产生如前列腺素等物质，这些物质会刺激神经末梢，同时，发烧引起的肌肉代谢加快，无氧酵解增多，产生乳酸堆积，也会导致全身酸痛。
一、炎症反应导致
当身体受到病原体入侵等情况引发发烧时，免疫系统被激活，会产生炎症反应。炎症介质会作用于周围神经，使得神经敏感性增高，从而让人感觉到全身疼痛。例如细菌或病毒感染引发发烧时，这种炎症相关的神经刺激较为常见。
二、肌肉代谢异常所致
发烧时体温升高，会影响肌肉的正常代谢。肌肉在异常代谢过程中，无氧呼吸加强，产生大量乳酸。乳酸堆积在肌肉组织中，就会刺激神经末梢，引起全身肌肉酸痛的感觉。
三、儿童特殊情况
儿童发烧时全身痛可能更为明显。儿童的神经系统发育尚未完全成熟，对疼痛的感知相对更敏感。而且儿童在发烧时往往活动量相对较大，肌肉代谢变化可能更显著，所以更容易出现全身痛的情况。同时，儿童的免疫系统处于发育阶段，炎症反应可能相对更强烈，也会加重全身痛的感受。
四、老年人需关注
老年人发烧时全身痛需要格外注意。老年人身体机能衰退，肌肉、神经等组织的适应性较差。发烧引起的炎症反应和肌肉代谢变化对老年人的影响可能更加明显，而且老年人可能同时伴有一些基础疾病，发烧可能会加重基础疾病相关的身体不适，全身痛的感觉可能会持续更久或更严重。