扁桃体经常发炎通常是由多种因素导致的。一般来说，人体免疫力低下时，比如儿童身体发育尚未完善，免疫力相对较弱，就容易让病菌趁虚而入引发扁桃体发炎，据统计，儿童扁桃体发炎的发生率相对较高。
病原体感染因素
细菌感染： 最常见的是A组乙型溶血性链球菌，这种细菌容易在人体抵抗力下降时侵袭扁桃体，引发炎症反应。比如在学校等人群密集场所，儿童之间容易相互传播这类细菌从而导致扁桃体反复发炎。病毒感染： 像腺病毒、鼻病毒等病毒也是引发扁桃体发炎的常见病原体。病毒感染往往具有一定的季节性，在秋冬季节或者春季交替时，病毒活跃，更容易导致扁桃体反复受感染发炎。
自身免疫相关因素
免疫功能紊乱： 当人体自身免疫系统出现问题时，也可能导致扁桃体经常发炎。例如自身免疫性疾病患者，免疫系统错误地攻击扁桃体组织，使得扁桃体反复处于炎症状态。而且一些患有基础疾病，如糖尿病等的人群，由于身体整体状况不佳，也会影响免疫系统对扁桃体的保护，进而导致扁桃体经常发炎。
局部因素影响
隐窝堵塞： 扁桃体表面有许多隐窝，如果隐窝被细菌、病毒及脱落上皮细胞等堵塞，就容易滋生细菌，引发炎症。比如长期不注意口腔卫生，食物残渣等容易堆积在扁桃体隐窝内，为细菌繁殖创造条件，从而导致扁桃体反复发炎。邻近器官炎症蔓延： 如鼻炎、咽炎等邻近器官的炎症如果没有得到及时控制，炎症可能蔓延到扁桃体，引起扁桃体发炎。例如患有慢性鼻炎的患者，鼻腔分泌物倒流刺激扁桃体，就容易导致扁桃体经常发炎。