慢性疲劳综合征是一种持续或反复发作的疲劳状态，患者通常会感觉极度疲惫，这种疲劳休息也无法缓解，且会持续至少6个月。
身体方面的症状
肌肉症状： 患者常常会有全身肌肉疼痛的情况，比如颈部、肩部、腰部等部位的肌肉容易出现酸痛感，而且可能会伴随肌肉无力，拿东西或者进行简单活动时都可能感觉使不上劲。骨骼症状： 部分患者会有关节疼痛，像膝关节、肘关节等关节可能会出现隐痛或者胀痛，并且这种疼痛可能会游走，今天这个关节痛，明天换另一个关节痛。
神经系统相关症状
认知障碍： 患者会出现记忆力减退的情况，比如经常忘记刚刚发生的事情，像刚才放在哪里的东西转眼就不记得了。还可能有注意力不集中的问题，在工作或者学习时很难长时间专注于一件事情。睡眠问题： 很多慢性疲劳综合征患者会有睡眠障碍，要么是入睡困难，躺在床上很久都无法进入睡眠状态；要么是睡眠质量差，容易惊醒，即使睡了一晚上，早上起来还是感觉没休息好。
其他系统症状
消化系统症状： 患者可能会有食欲不振的表现，对平时喜欢的食物也提不起兴趣，吃东西很少。还可能出现消化不良，感觉吃下去的东西很难消化，肚子容易胀气、不舒服。心血管系统症状： 部分患者会有心慌的症状，感觉心脏跳动不规律或者跳动过快，有时候在安静状态下也能明显感觉到心跳。另外，可能会有头晕的情况，尤其是从卧位突然站起时，头晕症状可能会加重。