胎儿脑积水的引起原因较多，其中约有25%-50%与胎儿染色体异常有关，比如21-三体综合征等染色体数目或结构异常情况。
一、先天发育异常导致
神经管发育畸形： 胎儿在发育过程中，神经管闭合出现障碍时，就可能引发脑积水。比如胚胎在妊娠早期受到某些不利因素影响，神经管闭合不全，使得脑脊液循环通路受阻，进而导致脑积水。遗传因素相关： 某些单基因遗传疾病也可能与胎儿脑积水的发生有关。例如一些家族性的遗传突变可能会影响胎儿脑部结构的正常发育，使得脑脊液的产生、循环或吸收出现异常，最终引发脑积水。
二、感染因素影响
孕期感染病毒： 孕妇在怀孕期间感染风疹病毒、巨细胞病毒等。例如，孕妇在孕早期感染风疹病毒，病毒可通过胎盘影响胎儿脑部发育，导致脑室系统脑脊液循环受阻，从而引发脑积水。据相关研究统计，孕期感染特定病毒后，胎儿发生脑积水的风险会有所增加。弓形虫感染： 孕妇感染弓形虫后，弓形虫可侵犯胎儿中枢神经系统，引起脑组织的炎症反应等，影响脑脊液的正常循环，进而导致脑积水的出现。
三、其他因素导致
孕期接触有害物质： 孕妇在孕期接触到某些有害物质，如铅、汞等重金属，或者是一些化学毒物等。这些有害物质可能会干扰胎儿脑部的正常发育过程，影响脑脊液的生成与循环，增加胎儿脑积水的发生几率。孕期用药不当： 孕妇在不知情的情况下服用了某些可能影响胎儿发育的药物，也可能与胎儿脑积水的发生有关。虽然这种情况相对较少，但确实存在因孕期不合理用药导致胎儿脑部发育异常，出现脑积水的案例。