跑步后膝盖两侧疼痛难忍可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的原因和建议：
1.跑步姿势不正确：如果跑步时膝盖内扣或过度外展，会增加膝盖两侧的压力，导致疼痛。建议调整跑步姿势，保持膝盖正对脚尖，不要过度内扣或外展。
2.肌肉力量不足：腿部肌肉力量不足也可能导致膝盖疼痛。建议进行一些针对腿部肌肉的力量训练，如深蹲、弓步蹲等。
3.过度疲劳：如果跑步距离过长或速度过快，会导致腿部肌肉过度疲劳，从而引起膝盖疼痛。建议适当减少跑步距离和速度，给身体足够的休息时间。
4.半月板损伤：半月板是膝盖内部的软骨结构，如果受到损伤，可能会导致膝盖疼痛。建议及时就医，进行详细的检查和诊断。
5.髂胫束综合征：髂胫束是连接髋关节和膝关节的一条带状组织，如果受到炎症或损伤，可能会引起膝盖外侧疼痛。建议进行物理治疗、按摩、针灸等方法缓解疼痛。
6.髌骨软化症：髌骨软化症是髌骨软骨的退行性病变，会导致膝盖前侧或髌骨周围疼痛。建议进行康复训练、物理治疗等方法缓解症状。
如果跑步后膝盖两侧疼痛难忍，建议采取以下措施：
1.立即停止跑步，休息一段时间，让膝盖得到充分的放松。
2.冰敷膝盖：用冰袋或冷毛巾敷在膝盖上，每次15-20分钟，每天数次，可以缓解疼痛和肿胀。
3.抬高腿部：将腿部抬高，高于心脏水平，有助于减轻膝盖的肿胀和疼痛。
4.使用止痛药：可以服用一些非甾体类抗炎药，如布洛芬、阿司匹林等，缓解疼痛。
5.寻求专业帮助：如果疼痛持续时间较长或症状严重，建议及时就医，寻求专业医生的帮助。医生可能会进行进一步的检查和治疗，如物理治疗、药物治疗、注射治疗等。
需要注意的是，每个人的身体状况和疼痛原因都不同，如果疼痛持续不缓解或加重，建议及时就医，以便得到更准确的诊断和治疗。同时，在跑步前要进行充分的热身运动，跑步后要进行拉伸和放松，保持良好的跑步姿势，选择合适的跑鞋，也有助于预防膝盖疼痛的发生。