怀孕40天做药流相对有一定安全性，但也有适用及禁忌情况。一般来说，怀孕49天内的宫内妊娠可以考虑药物流产，药物通常是米非司酮联合米索前列醇。
药流的适用人群
妊娠天数限制： 药流要求怀孕时间在49天以内，怀孕40天处于这个时间范围内是符合药流时间要求的。宫内妊娠： 必须通过B超检查确定是宫内怀孕，才能进行药流，如果是宫外孕是绝对不能药流的。
药流的禁忌人群
身体疾病方面： 患有严重心、肝、肾疾病的女性不适合药流；有青光眼、哮喘等疾病的患者也不宜选择药流。比如本身有严重心脏病的女性，药流过程中可能因子宫收缩等情况加重心脏负担。过敏情况： 对米非司酮、米索前列醇等药流药物过敏的女性不能做药流，否则可能引发严重过敏反应。
药流的可能风险
流产不全： 有10%左右的概率出现流产不全的情况，也就是胚胎组织没有完全排出体外，这时候就需要进行清宫手术，再次对子宫进行操作，增加感染等风险。阴道出血时间长： 药流后阴道出血时间一般在1 - 2周左右，但部分女性可能会超过2周，长时间出血容易导致贫血，也增加了感染妇科炎症的几率，出血时间超过2周就需要及时就医检查。感染风险： 药流过程中以及药流后，子宫颈口处于开放状态，细菌容易侵入，引发子宫内膜炎、盆腔炎等妇科感染性疾病。