怀孕三个多月头疼，原因较多，可能是受凉、情绪因素、低血糖、缺钙等导致。建议先就医检查明确原因，再在医生指导下进行相应治疗。具体如下：
一、受凉：怀孕后体内血液循环和新陈代谢加快，有些孕妇会体温升高、怕冷，若不注意保暖，受冷风刺激易引发头部不适。平时要多注意保暖，养成良好作息习惯，这有助于症状改善。
二、情绪因素：体内雌孕激素水平升高可能影响内分泌系统，出现植物神经功能紊乱，表现为头晕、视物模糊、胸闷、胃痛等。平时应多注意休息，保持良好心态，转移注意力以改善症状。
三、低血糖：糖摄入、生成不足或消耗过多会致血浆葡萄糖水平下降，患者可出现心悸、大汗、饥饿等症状。可及时补充含糖食物改善，症状严重者需及时就诊，通过静脉注射葡萄糖注射液治疗。
四、缺钙：妊娠时间增长，体内雌激素水平不稳定，且胎儿新陈代谢快需大量钙质，若体内钙量不足，可能导致大脑皮层兴奋，影响睡眠，出现头晕、头痛、失眠等症状。平时多吃含钙丰富食物，必要时在医生指导下使用维D钙咀嚼片、碳酸钙D3片、葡萄糖酸钙片等治疗。
除上述原因外，妊娠期高血压等也可能导致该症状。症状严重者应及时就诊，以免延误病情。
总之，怀孕三个多月头疼的原因多样，需根据具体情况采取相应措施。若症状持续不缓解或加重，应及时就医。