三个月宝宝消化不良的症状表现有腹胀、腹泻、呕吐、哭闹不止、食欲不振、口臭等。具体如下：
一、腹胀：宝宝由于胃肠道发育尚不完全，且母乳中可能存在不易消化的成分，这就容易引发宝宝消化不良，进而出现腹部胀气的状况。此时腹部会明显鼓起，宝宝可能还会伴有神情不安的表现。
1.宝宝胃肠道发育不成熟。
2.母乳成分的影响。
二、腹泻：这种情况还可能导致腹泻，宝宝胃肠道受到刺激后蠕动过快，就容易使大便变得稀薄，呈现绿色或泡沫状，同时还可能伴随腹泻症状。
1.胃肠道受刺激蠕动快。
2.大便的异常表现。
三、呕吐：消化不良也可能刺激宝宝胃部，使得局部肌肉痉挛，从而出现吐奶现象，吐出物呈现为豆腐渣状。
1.胃部受刺激。
2.吐奶的特征。
四、哭闹不止：宝宝因身体不适可能会持续哭闹。
五、食欲不振：消化不良会影响宝宝的食欲。
六、口臭：口腔可能会出现异味。
如果宝宝这些身体不适症状较为明显，家长一定要及时带其前往医院进行检查和治疗，以免延误病情。