时不时小腹隐隐作痛可能由多种原因引起。比如女性生理期时，部分女性可能会出现这种情况，一般持续时间因人而异，但有些可能会持续1 - 2天左右。而男性也可能因不同原因出现小腹隐痛。
妇科方面的原因
盆腔炎：女性盆腔内的器官如子宫、输卵管、卵巢等发生炎症时，就可能导致小腹隐隐作痛。盆腔炎分为急性和慢性，慢性盆腔炎往往会反复出现小腹隐痛，还可能伴有白带增多等症状。一般通过妇科检查等可以辅助诊断。子宫内膜异位症：子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位时，就会引发疾病。患者会出现小腹隐痛，而且这种疼痛可能会在月经期间加重，有的还会影响生育，通过B超等检查可能发现异常。
肠道方面的原因
肠易激综合征：这是一种常见的功能性肠道疾病，患者会出现小腹隐隐作痛，同时伴有排便习惯的改变，比如腹泻或者便秘，或者腹泻与便秘交替出现。这种情况往往与饮食、精神压力等因素有关，比如吃了辛辣刺激性食物后可能会加重症状。慢性肠炎：肠道长期受到炎症刺激，也会导致小腹隐隐作痛。可能是由于细菌、病毒等感染引起的慢性炎症，或者是自身免疫性因素导致。患者可能还会有腹泻、腹胀等表现，通过肠镜检查可以帮助明确诊断。
泌尿系统方面的原因
膀胱炎：膀胱发生炎症时，会出现小腹隐痛，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。女性由于尿道短，相对更容易发生膀胱炎，比如平时不注意个人卫生等情况就可能诱发。输尿管结石：输尿管内有结石时，也会引起小腹隐隐作痛，这种疼痛往往比较剧烈，但也有部分患者是隐隐作痛的情况。结石移动时可能会损伤输尿管黏膜，还可能伴有血尿等症状，通过泌尿系统超声等检查可以发现结石。