HPV16型阳性的治疗需要综合多方面来考虑。一般来说，对于HPV16型阳性的处理，首先要关注自身免疫力情况，因为人体有一定几率靠自身免疫力清除病毒，大约80%的女性感染HPV后，在1 - 2年内可依靠自身免疫系统清除病毒。
定期监测情况
HPV检测与TCT联合筛查： 感染HPV16型后，要定期进行HPV检测和宫颈液基细胞学检查（TCT），通常建议每6 - 12个月进行一次联合检查，通过这两项检查来观察宫颈细胞是否发生病变。如果TCT结果正常，仅HPV16型阳性，可继续定期监测。阴道镜检查时机： 当TCT结果异常，或者HPV持续感染超过1年以上时，就需要考虑进行阴道镜检查，通过阴道镜来更细致地观察宫颈局部情况，必要时还可能进行活检，以明确宫颈是否有病变。
针对病变情况治疗
低度病变的处理： 如果宫颈活检提示为低度鳞状上皮内病变（LSIL），由于部分低度病变可能会自然消退，所以可以继续密切观察，每6 - 12个月复查HPV和TCT。在观察期间，要注意保持良好的生活习惯，增强自身免疫力，比如保证充足的睡眠、合理饮食、适度运动等。高度病变的治疗： 若活检结果为高度鳞状上皮内病变（HSIL），这时候多需要进行治疗。一般会采用宫颈锥切术，如宫颈环形电切术（LEEP）或冷刀锥切术等，通过手术切除病变组织，防止病变进一步发展为宫颈癌。
增强免疫力助力清除
生活方式调整： 要保持规律的生活作息，每天保证7 - 8小时的睡眠时间。饮食上要均衡营养，多摄入富含维生素C、维生素E、蛋白质等营养物质的食物，像新鲜的蔬菜水果、瘦肉、鱼类、豆类等。同时，要避免吸烟和过度饮酒，因为吸烟和过量饮酒会降低人体免疫力，不利于HPV病毒的清除。适度运动锻炼： 可以选择适合自己的运动方式，如每周进行至少150分钟的中等强度有氧运动，像快走、慢跑、游泳等，运动能够促进身体的新陈代谢，增强体质，帮助提高自身免疫力来对抗HPV病毒。