扁桃体肥大的治疗方法需根据具体情况而定。一般来说，轻度的扁桃体肥大可以先通过保守治疗观察，而中重度的可能需要手术干预。
保守治疗方式
一般护理：
平时要让孩子多休息，保证充足的睡眠，饮食上要给孩子吃容易消化、营养丰富的食物，比如米粥、鸡蛋羹等。同时要让孩子多喝水，每天保证摄入1000 - 1500毫升的水，有助于保持呼吸道湿润，减轻扁桃体的炎症反应。还要注意室内空气流通，保持合适的温度和湿度，一般室温保持在22 - 25℃，湿度50% - 70%为宜。
药物治疗：
如果是细菌感染引起的扁桃体肥大，可使用抗生素治疗。常见的抗生素如青霉素类，像阿莫西林等。但使用抗生素时要注意，必须在医生的指导下使用，不能自行滥用。如果孩子对青霉素过敏，可选用头孢类抗生素等。另外，还可以使用一些局部喷雾药物，如西瓜霜喷剂等，直接作用于扁桃体部位，缓解疼痛和炎症，但使用时要按照说明书正确操作。
手术治疗情况
手术指征：
当扁桃体肥大导致孩子出现睡眠呼吸暂停、反复感染（一年发作7 - 8次及以上）、影响吞咽和发音等情况时，就需要考虑手术治疗。一般建议孩子在4岁以上，身体状况良好时进行手术。
手术方式：
目前常用的手术方式是扁桃体切除术，有传统的剥离法和现在常用的等离子消融术等。等离子消融术相对来说创伤较小，出血少，恢复快。手术后要让孩子卧床休息，前24小时最好吃冷流质食物，如冰淇淋、冷牛奶等，有助于减轻疼痛和肿胀。并且要密切观察孩子的出血情况，如果发现口腔内有较多鲜血流出，要及时告知医生进行处理。
康复期注意事项
扁桃体肥大无论是保守治疗还是手术治疗，在康复期都要注意观察孩子的恢复情况。保守治疗的孩子要按照医生的要求按时复诊，查看扁桃体炎症的恢复情况。手术治疗的孩子要注意口腔卫生，每天要用淡盐水漱口，一般术后1 - 2天就可以开始漱口，保持口腔清洁，预防感染。同时要让孩子逐渐恢复正常饮食，从冷流质过渡到半流质，再到正常饮食，一般术后1周左右可以吃软食，2周左右基本恢复正常饮食。