附件囊肿形成的原因有多种情况。一般来说，附件囊肿的形成可能与以下因素相关。首先是内分泌因素，卵巢是产生卵子并排卵、分泌内分泌激素、平衡内分泌的重要器官，当内分泌失调时，可能影响卵巢的正常功能，从而导致附件囊肿的形成，有研究发现约30% - 50%的附件囊肿与内分泌紊乱有关。
内分泌因素相关
激素失衡影响： 女性体内的雌激素、孕激素等激素水平如果出现异常波动，就可能干扰卵巢的正常生理过程。比如长期雌激素水平过高，可能刺激卵巢组织增生，进而增加附件囊肿形成的风险。像一些长期服用激素类药物或者患有内分泌疾病（如多囊卵巢综合征）的女性，更容易出现这种激素失衡情况。排卵相关影响： 在正常排卵过程中，如果卵泡没有正常破裂排出卵子，卵泡持续生长，就可能形成卵泡囊肿。这是比较常见的一种附件囊肿类型，通常与排卵异常有关。
炎症因素相关
盆腔炎症波及： 盆腔内的炎症，如输卵管炎、盆腔炎等，如果没有得到及时有效的治疗，炎症可能蔓延波及到附件区域，长期的炎症刺激会导致附件组织出现增生、包裹等情况，从而形成囊肿。例如，女性在产后、流产后如果发生感染，引发盆腔炎症，就可能增加附件囊肿的发生几率。邻近器官炎症蔓延： 周围邻近器官的炎症也可能影响到附件。比如阑尾炎，如果炎症没有控制好，炎症蔓延至附件部位，也可能引发附件囊肿。
子宫内膜异位因素相关
异位内膜种植： 子宫内膜组织出现在子宫体以外的部位时，就称为子宫内膜异位症。当异位的子宫内膜种植在卵巢等附件部位时，随着月经周期的变化，异位的内膜也会发生周期性出血，血液积聚在局部就可能形成囊肿，这种囊肿又被称为巧克力囊肿，是附件囊肿的一种特殊类型。病灶不断生长： 种植在附件部位的异位内膜病灶会不断生长，逐渐形成囊肿样的结构，而且这种囊肿会随着时间推移可能逐渐增大，对身体造成影响。