小脑萎缩目前尚无特效的根治药物，但可以通过一些药物来缓解症状或延缓病情进展。比如针对共济失调症状，可使用丁螺环酮等药物；对于伴有抑郁情绪的患者，可能会用到5-羟色胺再摄取抑制剂类药物，像舍曲林等，但具体用药需在医生指导下进行。
改善共济失调相关症状的药物
丁螺环酮： 可以在一定程度上改善小脑萎缩患者出现的共济失调相关症状，它通过作用于大脑中的5-羟色胺受体等发挥作用，但具体效果因个体差异而异。氯硝西泮： 对小脑萎缩导致的共济失调有一定的缓解作用，能抑制中枢神经系统的兴奋性，但长期使用可能会有嗜睡、乏力等不良反应，需密切关注。
针对精神心理症状的药物
舍曲林： 如果小脑萎缩患者伴有抑郁情绪，舍曲林是常用的5-羟色胺再摄取抑制剂类药物，能帮助改善抑郁状态，但用药后可能会出现恶心、腹泻等胃肠道反应，一般在用药初期较明显。氟哌啶醇： 当患者出现精神症状，如幻觉、妄想等时，可能会用到氟哌啶醇，但这类药物有导致锥体外系反应等风险，需谨慎使用，且要定期监测相关指标。
营养神经相关药物
甲钴胺： 属于B族维生素类药物，有营养神经的作用，可参与神经元的代谢等过程，对神经的修复有一定帮助，一般可以长期小剂量服用，但个别人可能会出现皮疹、食欲不振等不良反应。维生素B12： 也是营养神经的重要药物，能促进神经系统的正常发育和维持神经功能，对于小脑萎缩患者的神经保护有一定辅助作用，通常通过口服或注射等方式给药，注射时可能会有局部疼痛等情况。