引起血小板减少的原因有多种。血小板减少可能由血液系统疾病引起，比如再生障碍性贫血，约有半数以上的再生障碍性贫血患者会出现血小板减少的情况；还有急性白血病，白血病细胞在骨髓内大量增殖，会抑制正常造血，导致血小板生成减少。
一、自身免疫性因素相关
自身免疫性疾病导致：像系统性红斑狼疮，这是一种自身免疫紊乱的疾病，患者体内会产生攻击自身血小板的抗体，从而破坏血小板，使血小板数量减少。还有免疫性血小板减少性紫癜，这是最常见的因自身免疫导致血小板减少的疾病，体内产生的抗血小板抗体使得血小板在脾脏等部位被过度破坏。
二、感染因素影响
病毒感染：某些病毒感染可引起血小板减少，例如风疹病毒感染，在感染风疹病毒后，可能会影响骨髓的造血功能，导致血小板生成减少；还有EB病毒感染，感染EB病毒后，机体的免疫反应可能会波及血小板，使其数量下降。细菌感染：严重的细菌感染，如败血症，细菌产生的毒素等物质可能会影响骨髓造血以及破坏血小板，进而造成血小板减少。
三、药物因素导致
某些药物引起：一些药物可能会诱发血小板减少，比如化疗药物，像环磷酰胺等化疗药物在抑制肿瘤细胞的同时，也可能会抑制骨髓的正常造血，包括血小板的生成；还有一些抗生素，如氯霉素，长期或大量使用氯霉素可能会导致骨髓抑制，引起血小板减少。此外，像解热镇痛药中的阿司匹林等，也可能通过影响血小板的功能等机制导致血小板减少。