阴茎起小水泡的原因有很多，以下是一些可能的原因：
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒（HSV）感染引起，主要通过性接触传播。感染后，会在阴茎、龟头、冠状沟等部位出现水疱、溃疡等症状。生殖器疱疹容易复发，需要长期治疗。
2.梅毒：由梅毒螺旋体感染引起，主要通过性接触传播。感染后，一期梅毒会在阴茎等部位出现无痛性溃疡，二期梅毒会出现全身性皮疹。梅毒需要及时治疗，否则会导致严重的并发症。
3.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。感染后，会在阴茎、龟头、冠状沟等部位出现菜花状、乳头状的赘生物。尖锐湿疣可以通过物理治疗、药物治疗等方法去除疣体。
4.过敏反应：使用某些避孕套、润滑剂或清洁剂等可能导致过敏反应，引起阴茎起小水泡。
5.其他感染：如细菌感染、真菌感染等也可能导致阴茎起小水泡。
如果出现阴茎起小水泡的情况，建议及时就医，进行相关检查，明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意个人卫生，避免不洁性行为，保持阴茎清洁干燥。