阴茎起小水泡的原因可能有以下几点：
1.生殖器疱疹：由单纯疱疹病毒感染引起，主要通过性接触传播。感染后，阴茎上会出现水疱、溃疡，并伴有疼痛、瘙痒等症状。生殖器疱疹容易复发，需要长期治疗。
2.过敏反应：对避孕套、润滑剂或某些衣物材质过敏，可能导致阴茎起小水泡。此外，使用某些药物也可能引发过敏反应。
3.细菌感染：如龟头炎、包皮炎等，可导致阴茎皮肤红肿、起水泡，并伴有异味和分泌物。
4.病毒感染：如尖锐湿疣，是由人乳头瘤病毒感染引起的，主要通过性接触传播。病变部位会出现菜花状、乳头状的赘生物。
5.其他原因：摩擦、创伤、湿疹、接触性皮炎等也可能导致阴茎起小水泡。
需要注意的是，以上只是一些常见的原因，具体情况还需要根据个人症状、病史和相关检查来确定。如果出现阴茎起小水泡的情况，应及时就医，进行详细的诊断和治疗。同时，保持阴茎清洁、避免不洁性行为、注意个人卫生等也有助于预防此类问题的发生。