怀孕5周时进行B超检查，不一定能看见孕囊。通常情况下，怀孕5周时孕囊还较小，通过B超可能无法清晰地观察到孕囊。然而，具体情况可能因个体差异和超声设备的性能而有所不同。
以下是一些可能影响孕囊可见性的因素：
1.孕囊的位置：孕囊可能位于子宫的不同位置，如宫角、宫颈等，这可能会影响B超的检测。
2.超声技术：不同的超声技术和设备的分辨率也会对孕囊的显示产生影响。
如果怀孕5周时B超未能看见孕囊，医生可能会建议进行其他检查，如血液检查（如人绒毛膜促性腺激素（hCG）测定），以确认是否怀孕。此外，医生还会考虑以下情况：
1.受孕时间较短：如果月经周期不规律或受孕时间较晚，孕囊可能还未发育到可被B超检测到的程度。
2.异位妊娠：虽然罕见，但孕囊也可能位于子宫外，如输卵管、腹腔等，这种情况称为异位妊娠，需要及时诊断和处理。
3.其他问题：某些妇科疾病或其他因素也可能影响孕囊的可见性。
医生会根据具体情况综合判断，并在后续的孕期检查中密切监测孕囊的发育情况。一般来说，B超检查会在怀孕6-7周时进行，以更准确地确定孕囊的位置和发育情况。
需要注意的是，过早进行B超检查可能无法提供明确的结果，而且过度频繁的超声检查对胎儿可能也有潜在风险。因此，应遵循医生的建议，按照适当的时间进行孕期检查。
如果对怀孕5周时B超检查的结果有任何疑问或担忧，建议及时与医生沟通，以便获得更详细和个性化的建议。此外，在孕期中保持良好的生活习惯，如均衡饮食、适量运动、避免有害物质等，对胎儿的健康发育也非常重要。