月经快结束后腰疼可能由多种原因引起，其中较为常见的是生理性因素。一般来说，部分女性在月经快结束时，盆腔仍处于轻微充血状态，可能会出现腰疼，这种情况通常不影响正常生活，多在月经结束后1-2天内自行缓解。
生理性因素导致的腰疼
盆腔充血影响：月经期间，女性盆腔会处于充血状态，即使月经快结束时，盆腔充血可能还未完全消退，从而引起腰部的牵扯性疼痛。这种疼痛程度一般较轻，不伴随其他异常症状。激素变化影响：月经快结束时，体内激素水平仍有一定波动，可能会对腰部的肌肉、韧带等组织产生影响，导致腰疼。通常这种激素变化引起的腰疼，随着月经完全结束，激素水平逐渐平稳，腰疼也会随之减轻。
妇科疾病引发的腰疼
盆腔炎：如果女性本身有盆腔炎病史，在月经快结束时，炎症可能会有一定程度的活跃，从而引发腰疼。盆腔炎除了腰疼外，还可能伴有下腹部坠胀、疼痛，阴道分泌物增多等症状，而且盆腔炎的发生可能与性生活不卫生、宫腔操作等因素有关。子宫内膜异位症：子宫内膜异位症患者，异位的子宫内膜可能会在盆腔等部位种植，在月经快结束时，也可能出现腰疼情况。同时还可能有痛经进行性加重、月经异常等表现，这种病症多见于30-40岁的女性。
腰部本身问题导致的腰疼
腰肌劳损：有些女性本身有腰肌劳损的基础，在月经快结束时，身体的抵抗力等情况可能会有一定变化，或者腰部的负担等因素影响，会诱发或加重腰疼。腰肌劳损通常是因为长期腰部姿势不良、过度劳累等引起，表现为腰部一侧或两侧酸痛，久坐、久站后加重。腰椎间盘突出症：本身有腰椎间盘突出症的女性，在月经快结束时，身体的生理状态变化可能会影响腰部的神经、肌肉等，导致腰疼发作。腰椎间盘突出症除了腰疼外，还可能伴有下肢放射性疼痛、麻木等症状，多见于经常久坐、腰部负重的人群。