月经结束后腰疼，可能与以下因素有关。
1.生理因素
月经期间，盆腔充血，可能会导致腰部酸痛。月经结束后，充血的组织尚未完全恢复，可能会出现腰疼。
月经期间，身体会分泌前列腺素，前列腺素可能会引起子宫收缩，导致腰部疼痛。月经结束后，前列腺素水平尚未恢复正常，也可能会导致腰疼。
2.妇科疾病
盆腔炎：盆腔炎是指女性生殖器官、子宫周围结缔组织及盆腔腹膜的炎症。炎症可刺激腰部神经，导致腰疼。
子宫内膜异位症：子宫内膜异位症是指子宫内膜组织生长在子宫腔以外的部位。异位的子宫内膜可能会在经期出血，刺激周围组织，引起腰疼。
3.其他因素
劳累：月经期间身体较为虚弱，月经结束后如果过度劳累，可能会导致腰部肌肉酸痛。
腰部损伤：月经期间如果不注意腰部保暖，或进行了剧烈运动，可能会导致腰部损伤，月经结束后出现腰疼。
如果月经结束后腰疼症状持续不缓解，或伴有其他症状，如白带异常、下腹坠胀等，应及时就医，进行相关检查，如B超、妇科检查等，以明确病因，并进行针对性治疗。同时，月经期间应注意休息，避免过度劳累，注意腰部保暖，避免腰部受伤。